Una tècnica per a la determinació de la seqüència de bases d'un homogeni polynucleotide que actua com una plantilla en un sistema de replicació. A petita quantitat d'una específica dideoxynucleoside Trifosfat s'inclou amb els quatre triphosphates normal deoxynucleotide durant la replicació. Cadena cessament es produeix sempre que s'incorpora un dideoxynucleotide que genera un etiquetatge polynucleotide la longitut de la cadena, avaluat per polyacrylamide-gel d'electroforesi, és indicatiu de la distància de 5'-final de la cartilla de la posició en què es produeix el nucleòtid normal. Detecció de l'electroforesi bandes pot ser per una etiqueta com ³² P o, més recentment, per un fluorophore incorporat a la cartilla (seqüenciació d'imprimació tint) o la dideoxynucleotide (seqüenciació de tint terminator). De fet, en una variació del mètode tint terminator, l'etiquetatge de cadascuna de les quatre dideoxynucleotides amb un fluorophore que emet a un permís de diferents longitud d'ona la identificació de la base que acaba cada electroforesi banda dins una barreja separat de les quatre (seqüenciació de carril únic).