També conegut com mutant o auto-xifrar virus, un virus que pot canviar el seu patró de byte quan es replica, evitant detecció mitjançant tècniques d'escaneig-corda simples. Algunes utilitzen virus polimòrfics encriptació diferent règims i requereixen rutines diferents desxifrat. Per tant, el mateix virus pot semblar totalment diferent en cada sistema o fins i tot dins d'arxius separats. Altres virus polimòrfics varien seqüències d'instruccions i utilitzar les comandes fals en un intent per frustrar programari antivirus. Un dels més avançats virus polimòrfics utilitza un motor de mutació i generadors de nombres aleatoris per canviar el codi de virus i la seva rutina de desxifrat.