Una tècnica de separació d'un flux d'ions grans de accelerats en un camp magnètic. La resistència a la desviació de l'Ió del seu camí és una mesura de l'impuls de l'ió i per tant de la seva massa. En les primeres versions, el material de Mostra va ser volatilized per la calor i ionitzats per un feix d'electrons. Més tard tècniques de portar la Mostra fora la fase líquida o sòlida, és a dir, poden ser la desorció i ionització, són ràpid-Àtom bombardeig MS (FA-MS) per un feix d'ions i de plasma poden ser la desorció MS (PD-MS) per irradiació els núclids filla de desintegració 252Cf. En camp-poden ser la desorció MS (FD-MS) la Mostra està ionitzat primer i llavors volatilized, un procés que indueix estrès tèrmic molt menys sobre la mostra que MS camp-ionització, en què la mostra és volatilized primer i llavors ionitzats en un camp electrostàtic. En poden ser la laser-assistida desorció MS (LD-MS) i poden ser la desorció/ionització de làser assistida per matriu (MALDI-MS) la Mostra MS intercanvia energia amb una matriu sòlida o líquida per tal de minimitzar els danys a la Mostra i aïllar una molècula de mostres d'altres. En el electrospray ionització MS (ES-MS), atomització extraordinària de partícules de solució d'ions de proteïna de la qual el dissolvent és evaporat en vacuo fulles multiplicar acusat ions de proteïnes.