Mewtwo és un del primer Pokémon creada per la ciència. Els científics que el va crear somiat amb crear el Pokémon més fort del món. Està considerat únic, perquè només un genèticament neix. No obstant això, això encara ha de ser plenament confirmada.

Mewtwo és una criatura amb una postura humanoide, però té uns quants trets felins. Cos de Mewtwo és grisenc-porpra amb una part inferior color porpra i una llarga, porpra cua. Mewtwo té tres dits circulars en cada apèndix. Té els ulls porpres (de vegades blaus quan atacava) i dues orelles curtes.Característiques de

de Mewtwo més notables és el tub que s'estén des de la part posterior del seu crani a l'espina dorsal. El més probable és un secundari medul·la espinal, o un sistema dels nervis, que permet una major quantitat de sang i la transmissió sensorial al cervell, augmentant els seus poders psíquics.